1樓：
這明顯是在以喻代證嘛。
作業系統，以及硬體（CPU、GPU、各種儲存器、輔助晶元等）的規則都是人為規定的，都是事先定好的，而且人類可以根據自己的需求修改其中的規則。計算機程式設計的過程是人類事先學習這其中的規則，然後根據這些規則來編寫程式，以服務人類自身。
而物理，其規律是事先存在的，是相對穩定不變的，人類研究物理的過程是通過一系列的實驗、推理來認識這些規律的過程。
2樓：lysine
畢竟現代數學和物理和電腦科學都是源於西方，而西方科學或者說文化的乙個重要特點就是形式化，而這個觀點從Plato甚至更早就已經顯現，比如其著名的ideal form的觀點，西方文化中總是覺得存在乙個ultimate reality，而form正是其的乙個方式，所以大多數科學都是向著嚴格的形式化和抽象化趨向（尤其是電腦科學以及數學還有與現象世界相關的物理學），所以它們越來越像是很自然的（畢竟西方人認為形式化才是事物抽象的本質（也就是不變的實在））。
此外，電腦科學所依賴的數理邏輯中的乙個重要思想就是形式化推演（從部分有限個公理出發通過規則進行形式推演），而物理是通過一些假設（源於人們觀察自然總結），之後進行演繹。所以從這個層面來講兩者是很像，不過物理既然是科學，科學的本質是可證偽性，說到底就是假說，需要不斷實證去批判檢驗科學。對於電腦科學而言，其根本的原理數理邏輯中，檢驗正確的方式則是其形式推演的合法性（validity），而且要符合其語義層面上的意味，但是對於一階邏輯而言，這個系統是可靠的和完備的，但是對於二階邏輯（更加細化，有了任意，存在等量詞等）而言，是有哥德爾不完備定理的，也就是說存在一些定理，雖然實在語義上是正確的（即，可以說就是正確的命題），但是在用形式推演證明是無法證明的。
此外電腦科學的核心我覺得就是把事物通過編碼利用演算法可計算化，從而解決各種問題。而物理的核心還是根據現象或者實驗提出假說，建立體系，進行演繹推演，之後在用實驗證明。實質上兩者思維方式是不同的。
至於兩者越來越像，也是表現了兩者知識體系形式的相似性（注意這裡仍然是形式化的「像」），至於說為什麼我覺得只能這麼分析了（主要還是文化，思維方式，語言，哲學基礎的鍋…）
…以上為個人拙見，才疏學淺，而且一激動還扯遠了，…抱歉…
3樓：JasonYoung
題主用這種作業系統的模擬隱含了乙個假設:
物理，或者說自然科學的知識是由乙個有限的真理集構成的。
由此得出的結論應該是:
整個自然界是乙個作業系統，甚至是乙個更基本的硬體系統在運作的結果。
我們作為能夠向自然界探索規律的智慧型生命，更像是乙個能夠理解自身所處「作業系統」的乙個小程式。
而我們探索形成的理論，越是高階，越是貼近這個「作業系統」的本質。
(以上是對1-3條的簡單糾正)
所以呢，程式設計與物理本質上的區別在於，程式設計是人為擴充我們的真理集(演算法、資料結構等等)，物理在於探索更廣闊的真理集(自然規律)。
另一方面，數學反而比物理更為契合題主的模擬:
數學是人類創造的，規律先於人存在，但數學不是。
數學的發展史就是人類擴充名為數學的知識集合的歷史，就個人觀點，應該是沒有來自客觀實在的限制的，只有主觀邏輯檢驗正確性。
數學通過發展各種型別的「數」(資料結構)與「運算」(演算法)，實現更多的功能。
這樣來看，數學確實與物理不同，卻與程式設計更相似。
至於後面的「模型」，只要上面本質的區別沒有搞混，是可以仁者見仁，智者見智的。
下面是順著上面的思路一點瞎想(*σ`)σ
【高度發展的人類文明有一天突發奇想，做了乙個封閉的空間，並安置了能實現大量功能的電子器械和有認知系統的人工智慧機械人。
有一天，乙個人工智慧機械人產生了乙個超越這個電子器械功能的需求。
為了實現這個功能，他不得不開始研究這個電子器械。
於是，他將這個探索事物本質(因為空間上只有這個事物了)的學科稱為「物理學」。
這樣，這門「物理學」發展的過程，就是這個機械人對人類預先設定好的作業系統的探索過程。
為了更好的記錄規律，他又發展了乙個學科「數學」，來描述這個作業系統的內在邏輯。
(這個故事看來可以一直寫下去)】
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