2016 11 11這篇跟NgAgo有關的實驗文章,大家怎麼看?

時間 2021-05-11 08:30:29

1樓:深藍之藍

這篇文章有點兒稀里糊塗。他們猜測對rna水平的調控是通過轉錄進行的。按照這個邏輯推測,ago是結合DNA的,但是種種跡象表明,這一點是存疑的。

我們通過ago-gfp標記端粒無表型,這個原因是ago不結合或者結合弱。但北京大學分子醫學研究所教授熊敬維則說,他們還構建了 FokⅠ-NgAgo 融合蛋白來研究 NgAgo/gDNA 是否在 293T 細胞中有介導靶基因突變的功能,他們研究了3個靶基因,沒有發現突變,這就詭異啦!如果ago有結合活性而無切割活性,連上fokl就變成talen啦 。

所以這篇cell res也是存在問題的。

綜上兩實驗所述,ago對rna水平的影響應該不是通過控制轉錄進行的,可能是通過影響rna的降解或者翻譯過程。

2樓:雨花

背景知識介紹略過,廢話不說了,懂的都懂,不懂的也不關心細節。總之NgAgo要完。

Ago家族在脊椎動物和高等植物中的同源蛋白本來就擔任RNA切割降解的功能,RNAi和miRNA都是依賴Ago起作用的,所以降解mRNA倒也在情理之中,不過這樣NgAgo就沒什麼實用價值了,用這個工具還不如直接RNAi。

而且以前就有人在別的體系中提出類似結果,韓教授的根本理論(NgAgo是編輯基因而不是RNAi)實質上已經被推翻了。

3樓:

如果是我,把這個dngago改造一下,加個cas9的切割酶,用ssDNA引導dngago-cas9去切割就好了。這樣可以保證ssDNA的安全效能和cas9的切割效率。畢竟dngago的優勢就在於ssDNA的安全性。

所以我還是相信韓春雨的實驗結果,但是我懷疑他無意或者有意隱瞞了酶活性改造的位點,這倒是可能的。只是一點小想法,我覺得韓的發現還是有意義的。但是,可能這種蛋白改造還需要專業人士來進行,所以期待進一步的實驗結果。

4樓:陶埜

賭100韓教授會在下次採訪的時候說出:「Cell證實實驗可重複。」

然而事實上這篇文章並沒有證明NgAgo可以產生韓春雨文章裡面的那些效果,反而認為NgAgo無法knockout,即:該篇文章無法證明韓的工作可重複。這點高票已經說明的很清楚了。

那麼說出這句話的人到底是不是芳草天,相信吃瓜群眾們是能看的清楚的。

5樓:憤怒紅

工作概括:

在多個基因中驗證了同時注射NgAgo-ssDNA能夠在不引起基因突變(DNA)的情況下降低基因表達(mRNA)

結論:

在斑馬魚中NgAgo-ssDNA複合體是通過降低基因表達而不是引入基因突變發揮作用,the gDNA/NgAgo system provides an alternative strategy for gene kncokdown in zebrifish(NgAgo系統是一種新的基因敲低系統)

WTF,說好的新一代基因編輯工具呢?

作者進行了一些排除特殊情況干擾的實驗:

A.單獨的NgAgo不行,單獨的ssDNA也不行(排除ASO途徑)

→要在一起才有作用,但不能證明是否需要形成複合體,要證明這個,可能還要進行體外結合實驗或者IP-seq。

B.合成與原ssDNA方向相反的gDNA,仍然有敲低效果→

→敲低效果應該不是作用在mRNA上的。

C.斑馬魚養在28.5℃水箱中,高溫會引起發育異常,然後作者殘忍地嘗試將溫度提高到NgAgo的工作溫度37℃,然並卵;→

→溫度說,這鍋我不背!

D.對NgAgo進行了去酶活性突變,發現基因敲低現象槓槓的;→

→根本不依賴NgAgo的核酸酶活性啊,不知道NgAgo是不是還有隱藏其他的神奇能力。

E.反義嗎啉代介導的翻譯阻遏和Cas9介導的敲除都能達到NgAgo/ssDNA相同的表型;→

→不想解釋了。

所以,這篇文章並不能替韓主席背書,甚至還拍了拍他的光頭……

當然,我們還不能就此完全否認韓主席工作的真實性,畢竟人的細胞和斑馬魚可能不一樣,萬一韓老師養的人源細胞裡寄生了什麼畫風清奇、武功高強的細菌呢,或許韓老師最近正在日日夜夜鑽研啊!

夢想還是要有的,萬一實現了呢?我們可以先定個小目標,比如發他個Nature子刊?

說實話,我反韓反得都有慣性了。我擔驚受怕地看了半天文章,生怕出現了哪怕1%的基因編輯效果,結果證明我是虛驚一場,趕緊上來怒答一發壓壓驚!

6樓:郭昊天

卸腰。文章內容實際上就兩條:

1. NgAgo不能在斑馬魚裡做基因組編輯(knockout)2. NgAgo能夠抑制RNA表達(knockdown),機制不明與韓春雨所聲稱的NgAgo的功能完全相反

(P.S. 剛剛看到BioArt的採訪,通訊作者劉東「含蓄地表示」:「並沒有支援或反駁韓教授的結果」。這個用詞很精準…這篇Cell Research

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