分子生物學螢光定量PCR實驗中會遇到哪些問題?

時間 2021-06-02 12:11:48

1樓:Whelixy

1 做螢光定量PCR之前,考慮到的是你能接觸到什麼機型的PCR儀,不同的PCR儀相容的耗材以及試劑不一樣的,如果你沒有別人帶,自己第一次做,一定要注意。

2 做螢光定量PCR最重要的莫過於,引物和模板的準備。提取RNA之後一定要電泳檢測其降解狀態,如果發生了降解很容易導致結果偏差;引物設計的好壞直接關係著後續實驗的成功,所以引物合成回來,可以做個普通的pcr,跑電泳驗證其特異性。如果同時要檢測很多的基因,那麼設計的時候,引物的Tm最好都相近在60度左右,擴增產物150bp左右最好,有利於操作。

3 螢光定量PCR的體系確定,大的體系容錯率可能稍微高一點,小的體系對操作的精度和準度要求比較高,但是可以很好的的節省cDNA模板。如果沒有電動的分液槍,要熟練的使用普通移液器。

4 進行具體實驗之前,要測定引物的擴增效率,通常來說,比較兩種處理中基因表達的差異是需要內參基因的,這樣的比較,是假定興趣基因引物以及內參基因的擴增效率相同且為1的。如果引物太多,可以看螢光定量PCR的擴增曲線,如果形態相近的話,一般也認為擴增效率是一致的。

5 螢光定量PCR最少設定三個技術性重複組,同時一定要有空白對照組,有很多人沒有這種習慣,其實很危險。

6 螢光定量PCR的程式和普通PCR不同,會多乙個melting的部分,同時三步迴圈中延伸的部分可以去掉,節省時間。

7 螢光定量PCR結束之後要去看下溶解度曲線,每種擴增產物的曲線為單峰既Ok

8 資料的處理,這部分首先要根據sd值判斷資料質量。如果重複組資料波動很大,則會導致結果不可信,當然如果設定的重複組較多,有些明顯的單個異常值可以去掉,優化資料。最後需要根據不同的目的來對資料進行不同的計算處理。

2樓:HonYi Chang

沒直接做過這個實驗,但是我在學習的時候老師不斷地強調,螢光定量PCR的最重要也是最容易出錯的一點就是確保螢光位點已經在PCR中鏈結上去,詳細證明方法只有匯入受體後才能證明,所以要極其認真小心PCR,免得多次失敗後心態崩了。

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