組織測序失敗!請教 化療期間什麼時候可以進行血液基因檢測?血液檢測有效率?是不是要做全外顯子?

時間 2021-06-03 20:38:51

1樓:楚楚

感謝各位專業的回覆。組織測序失敗是因為穿刺組織腫瘤含量不足導致的。下面是病理。因為老人不想再穿刺一次組織,所以考慮是否血液測序。

2樓:海盜船輪機長-6390

問題是組織測序失敗的原因。

血液基因檢測最好在化療前或是化療後一段時間,確保有腫瘤dna釋放到血液中,才可能測到。

不一定要測全外,針對特定癌腫檢測相關基因就行。

3樓:基因農民工

組織測序失敗的原因是什麼?核酸不合格?文庫不合格?還是資料不合格?

化療期間可以做血液基因檢測,但是血液的靈敏度低於組織,組織是腫瘤檢測的金標準。至於做不做全外顯子,取決於你的需求,不是所有人的需要做全外顯子,而且全外顯子的檢測成本很高,過度檢測。

4樓:

好奇組織測序失敗的原因是什麼,組織量不夠?還是固定和石蠟包埋不過關導致DNA質量太差?

一般認為組織檢測的靈敏度比血液ctDNA檢測靈敏度要高,所以最好還是用組織,實在不行才用血液。

血液ctDNA的NGS檢測靈敏度,這個問題就有點複雜了,因為檢測靈敏度和測序深度、分析演算法有關,同時還和檢測的基因和檢測的突變型別有關,所以不同檢測公司、不同檢測專案的檢測靈敏度可能都會有區別。

要不要做全外顯子的問題,建議可以優先考慮腫瘤大panel。全外顯子的優勢在於檢測的基因比較全,覆蓋全面,同時對於拷貝數變異的檢測比較容易。但缺點是測序深度做不到太深,一般在1000x左右,因此檢測靈敏度較低;同時全外顯子檢測對於內含子基本沒覆蓋,因此很難檢測基因融合。

而腫瘤大panel的測序深度可以到10000x以上,檢測靈敏度較高,同時可以檢測常見融合基因。而前面說到了,對於血液樣本而言,檢測靈敏度是非常重要的。

關於取樣,建議是在兩次化療的中間取樣,最好是在前次化療兩周後取樣。

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