1樓：
本篇博文屬於恰飯哦，但是對你也有作用哦！！
現在自己也分享一下自己這個歷程，最後，還是一句話，「使用R畫圖，資料準備非常非常的重要」。
第一列，gene_id， 後面是重複，3個重複，我的共4個處理資料，12組
#檔案所在位置
setwd("I:FPKM")
library(pheatmap)
#BiocManager::install("heatmaps") #如沒有按照「pheatmap包請安裝」
dataset <- read.table('FPKM_聚類圖資料.txt',header = TRUE, row.names = 1)
# 構建樣本分類資料
sample_calss=c(rep('CS_Leaf',3rep('CK_Lead',3rep('CS_Root',3rep('CK_Root',3))
level = c(1:12)
annotation_c <- data.frame(sample_calss, level)
rownames(annotation_c) <- colnames(exp_ds)
gene_class=c(rep('High',30rep('Low',30))
sample_type=c(rep('CS',20rep('CK',20rep('Immunology',20))
annotation_r <- data.frame(gene_class, gene_type)
rownames(annotation_r) <- rownames(exp_ds)
pheatmap(exp_ds, #表達資料cluster_rows = T,#行聚類cluster_cols = T,#列聚類annotation_col =annotation_c, #樣本分類資料annotation_row = annotation_rannotation_legend=TRUE, # 顯示樣本分類show_rownames = T,# 顯示行名scale = "row", #對行標準化color =colorRampPalette(c("#8854d0", "#ffffff","#fa8231"))(100), # 熱圖基準顏色)
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