1樓：
大部分的生物都有barcode gene。像細菌是16S，真菌是ITS，植物，動物也都有。可以和現有的資料庫比對，找到與其最相似的已知物種。
當然，還是要有形態學的資訊。現在大部分的微生物都是知道基因序列卻無法分離培養（Archaearhizomycetes）。或者分離培養了，卻死活不進入有性生殖（比如Fusarium），活活急死你。
2樓：Tang Boyun
你問的問題是生物分類問題，這個一般是查檢索表。
更新喂,喂,這個答案果然吸引了一堆懂一些生信,但卻是拿著榔頭找釘子的人。
樓主問得是新種鑑定，不是要做進化、親緣關係。也就是微生物看不見摸不著，基因組又簡單，找個16s rDNA可以分分類。其餘的巨集觀的動植物為啥要上分子手段呢？
拿本地區動植物志，翻下檢索表很高深麼？區域查不到查中國，再查不到查世界。
說上序列的？現在測過幾百個基因組就能做新種鑑定了？以魚類為例，河豚只有約300m的基因組（已測），鯊魚有10-20G，肺魚80-120G，變化有多大？
有特徵序列？沒測過怎麼知道？
只有看不到形態特徵的場景，比如，肉類鑑定，那需要上分子，而且只能做到在給定的物種範圍內區分。
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