怎麼理解楊榮武《生物化學原理》28頁中肽鏈的 轉角的I型和II型區別在於2 3號殘基肽鏈旋轉180 ?

時間 2021-06-09 12:50:12

1樓:Liang Shi

Φi+1

ψi+1

Φi+2

ψi+2

type I

-60-30

-900

type II

-60120800

type I』

6030900

type II』

60-120

-800

其中,Φ和ψ分別表示氨基酸殘基主鏈的兩個二面角,這裡展示的資料來自β轉角的第2、3號氨基酸殘基(i+1和i+2)。另外,type I』和type II』指的是type I和type II的映象。可以看到,II型的第2號氨基酸殘基的ψ二面角旋轉了180度。

不論是哪種β轉角,第1、4號氨基酸殘基間總是形成氫鍵,這是維持β轉角穩定性的原因。甘氨酸在空間構象上提供正的Φ,而脯氨酸傾向於提供負的Φ。所以你可以看到兩種β轉角的Φi+1均為-60度,因為第2號氨基酸殘基往往是脯氨酸;而type II的Φi+2為80度,因為type II的第3號氨基酸殘基往往是甘氨酸。

但是這兩種β轉角是可以互相轉化的。在某些條件下,第2號氨基酸殘基的CO-NH肽鍵可以旋轉180度,改變ψ二面角,被稱為肽鏈平面翻轉。

最後貼一張β轉角的空間結構圖,希望便於你理解。上圖為I型,下圖為II型。

僅展示肽鏈的主鏈原子(不包含氫原子)。其中灰色為碳原子,紅色為氧原子,藍色為氮原子,紫色連線線為氫鍵。

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