1樓:Liang Shi
Φi+1
ψi+1
Φi+2
ψi+2
type I
-60-30
-900
type II
-60120800
type I』
6030900
type II』
60-120
-800
其中,Φ和ψ分別表示氨基酸殘基主鏈的兩個二面角,這裡展示的資料來自β轉角的第2、3號氨基酸殘基(i+1和i+2)。另外,type I』和type II』指的是type I和type II的映象。可以看到,II型的第2號氨基酸殘基的ψ二面角旋轉了180度。
不論是哪種β轉角,第1、4號氨基酸殘基間總是形成氫鍵,這是維持β轉角穩定性的原因。甘氨酸在空間構象上提供正的Φ,而脯氨酸傾向於提供負的Φ。所以你可以看到兩種β轉角的Φi+1均為-60度,因為第2號氨基酸殘基往往是脯氨酸;而type II的Φi+2為80度,因為type II的第3號氨基酸殘基往往是甘氨酸。
但是這兩種β轉角是可以互相轉化的。在某些條件下,第2號氨基酸殘基的CO-NH肽鍵可以旋轉180度,改變ψ二面角,被稱為肽鏈平面翻轉。
最後貼一張β轉角的空間結構圖,希望便於你理解。上圖為I型,下圖為II型。
僅展示肽鏈的主鏈原子(不包含氫原子)。其中灰色為碳原子,紅色為氧原子,藍色為氮原子,紫色連線線為氫鍵。
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